Con el cambio de gobierno, el Programa Ser Pilo Paga llegó a su fin después de 4 años activo. El gobierno de Iván Duque, sin embargo, en el 2018 dio inicio a un nuevo programa de educación superior que pudiera reemplazar a Ser Pilo Paga y siguiera dando educación superior a jóvenes en condición de vulnerabilidad económica. El Programa Generación E componente Excelencia, al igual que Ser Pilo Paga, está dirigido a los mejores bachilleres del país. 

Una de las similitudes entre ambos programas es que los dos son créditos educativos que se condonan totalmente si el estudiante finaliza y se gradúa de la carrera que escoge. 

• El puntaje mínimo requerido en las pruebas saber 11 para acceder al beneficio que cubre la totalidad y la matrícula académica fue de 350 para este año en Generación E. 
• Con el actual programa, se incentiva más a los estudiantes a ingresar a universidades públicas, puesto que éste asume el 100% de la carrera sólo con estas instituciones. 
• Si el estudiante ingresa por componente de excelencia a una universidad privada, el programa asume el 50% de la carrera, un 25% es asumido por la institución y el 25% restante por el mismo estudiante.
• El componente de Equidad financia hasta 4 SMMLV del valor de matrícula cobrado por instituciones de educación superior públicas.
• La cobertura del programa Generación E se espera que sea de 320.000 estudiantes en 4 años. El programa Ser Pilo Paga sólo benefició a 40.000 estudiantes aproximadamente durante el mismo periodo de tiempo. 
• Hay más instituciones de educación superior dentro de Generación E. Por ello, el beneficio puede llegar hasta zonas rurales. 
• Con el fin de asegurar la excelencia académica y disminuir la deserciòn, el programa propone herramientas de educación de estudio tales como cursos gratuitos en Open English (reconocida escuela de idiomas) y cursos virtuales que ofrecerá el SENA con la intención de ayudar a los estudiantes a adquirir habilidades para su inserción social y económica. 

Una de las cosas que más se le criticó al Programa Ser Pilo Paga fue el que la mayoría de sus recursos fueran destinados a IES privadas y sólo el 5% de los recursos han sido dirigidos a las universidades públicas. En Barranquilla, los estudiantes pilos sólo podían estudiar en la Universidad del Norte, la Universidad Libre y la última generación tuvo también la Universidad Simón Bolívar como opción. 

Con el actual programa, la Universidad del Atlántico sí se ha visto beneficiada. 2179 estudiantes beneficiarios por Generación E ingresaron a estudiar a la universidad pública de Barranquilla. Como el beneficio del crédito se comunicó de manera tardía, a los estudiantes que ya se habían matriculado en la institución y quedaron dentro de Generación E, se les devolvió el costo de la matrícula.